磁选是石英砂常用的提纯方法之一，是石英砂生产过程中必不可少的工序，其优点是选择性强，去除的杂质主要有以磁铁矿为主的强磁性矿物和以赤铁矿、褐铁矿和黑云母等为主的弱磁性杂质矿物，在保持有效地去除杂质的同时，还能获得很高的石英砂产量。在磁选工艺中，湿式强磁选机可以最大限度地清除包括连生体颗粒在内的赤铁矿、褐铁矿和黑云母等弱磁性杂质矿物。一般而言，对含杂以弱磁性杂质矿物为主的石英砂，利用湿式强磁机在10000奥斯特以上可以选出；对含杂质以磁铁矿为主的强磁性矿物，则采用弱磁机或中磁机进行选取效果比较好。在生产中采用湿式强磁选机最佳可获得Fe2O3为0.036%的优质石英砂精矿。湿式强磁选机除铁效果受给料量、冲洗水量、磁场强度等参数影响，其中以磁场强度影响最大。另外，磁选次数越多，石英砂粒度越细，除铁效果越好。

    对于细粒或微细粒矿物，由于颗粒之间的相互吸附作用增强，磁性和非磁性物之间夹杂严重，如采用干法分选，难以将磁性物去除干净，一般需采用湿法。在湿式分选的情况下，通常可以增加漂洗、脉动等辅助方式，破坏磁性物和非磁性物之间的夹杂，有效地提高了磁性物被磁场捕捉的概率。